Чернояр упоминается в ревизской сказке 1816 года по Шацкому уезду как деревня. Также сохранилась ревизия 1858 года, где переписаны крестьяне статского советника Иммануила Дмитриевича Нарышкина.
В статистических списках населённых мест от 1862 года Чернояр фигурирует как владельческое село при речке Выше по правую сторону р. Цны. Всего тогда было дворов - 28, в которых проживало мужчин - 150, женщин - 123. Расстояние от центра уезда составляло 48 км.
В епархиальных сведениях 1911 года сказано, что деревянная тёплая церковь Архистратига Михаила в селе Чернояр была построена в 1858 году. Всего на 1911 год в селе было 290 дворов, где проживали 770 мужчин и 971 женщина. В приходе деревни Кукушка и Морсово. Имелось две одноклассных школы - церковно-приходская и земская.
Сейчас село Чернояр относится к Земетчинскому району Пензенской области. 4